并不是所有人都适合在试管婴儿新鲜周期进行移植。取卵很多、雌二醇特别高的患者，容易发生卵巢过度刺激征，如贸然坚持移植，发生重度卵巢过度刺激征的可能性就很大，比较危险。内膜回声不均匀或形态不好，或打夜针当天孕酮较高的患者，也不建议新鲜周期进行移植;内膜是胚胎的土地，如果土地不好，那么种子也不好发芽。所以，医生会建议取消移植，下次做一个好的内膜再行冷冻周期的胚胎移植。
输卵管积水明显的患者也不建议新鲜周期移植。因为输卵管积水可能会被排出来冲刷胚胎，其有胚胎毒性作用。还有极少数患者因为没有可以移植的胚胎而不能移植。虽然取到了卵子，但是可能有以下情况发生：卵子精子受精异常, 如不受精或多精受精;受精后形成的胚胎不分裂、碎了或死了;卵子发育异常不成熟等。临床医生会和胚胎实验室研究员们进行沟通，寻找原因，为下次试管婴儿周期准备对策。胚胎已经保存好了，此时此刻你需要一个适合胚胎种植的子宫内膜。
如果月经规律，排卵正常，可以用自然周期。卵泡成熟后排卵，留在卵巢内的部分形成黄体，内膜开始转换成为分泌期内膜;如果卵子受精形成受精卵，在排卵后第7天左右便可达到子宫内膜开始种植。自然周期的卵子不受精，此时的子宫内膜仍是为受精卵准备的，按照胚胎的日龄算出在排卵后第几天移植。月经黄体也形成了妊娠黄体，支持移植的胚胎种植和生长，可以不再使用或只需使用很小剂量的黄体激素进行黄体支持。
如果月经不规律，常常闭经或患有严重得多囊卵巢综合征，可以考虑降调节+人工周期方法。降调节与试管婴儿促排前的降调节一样，用药物抑制垂体的功能，以方便医生完全用人工的方法来制作一个漂亮的内膜。垂体丧失功能后，子宫内膜如白纸一般，任医生在上面作画。使用合适剂量的雌二醇模拟卵泡期，使用绒促性素模拟排卵的过程，再使用孕酮模拟排卵后的黄体期，这样子宫内膜经历了如同自然周期般的变化，也变成了适合胚胎种植的温床。绒促性素注射当日如同排卵日，同样根据胚胎的日龄选择排卵后第几天移植。只不过，服用的雌二醇和孕激素不能停，要一直服用，至见着胎心搏动后再慢慢减量。
还有一种方法是促排卵，也是人工周期，适用于排卵不规律或卵泡期长的患者。美国试管婴儿专家介绍,与自然周期类似，通过服用药物使卵泡正常生长发育和排出，从排卵日计算移植胚胎的时间。但是促排卵药可能存在溶解黄体功能的不良反应，患者需口服小剂量的孕酮进行黄体支持。有一类患者，子宫内膜特别薄，只能通过尝试各种方法做出一个漂亮的子宫内膜。还有一部分患者的内膜怎么看都不漂亮，就先做宫腔镜检查，找找是否存在病变，治疗之后再进行冻胚移植。
孕育种子的肥沃土壤已经准备就绪，只等胚胎实验室将种子从冬眠中唤醒，之后的移植就和新鲜周期的移植没有差别。
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