偶然发生自然流产或胚胎停育的风险约10%，也许没有原因，也许存在原因。医生建议先观察，如果第2次妊娠仍出现这种情况，则需全面检查。有一部分患者比较担心这个问题，为了消除疑虑也会前来就诊。如果出现多次自然流产或胚胎停育该怎么办呢？建议先就诊找出原因。包括双方染色体、血型（如果女方0型，男方非0型需查抗血型抗体）；女方甲状腺功能、生殖激素六项、凝血功能、自身免疫抗体、产前病毒五项；男方精液常规和畸形率染色体等。
早期自然流产和胚胎停育的主要原因是染色体异常，除了父亲或母亲染色体异常外，还有一种情况是双亲染色体正常而形成胚胎时发生染色体异常或突变。女方0型血，男方非0型血导致溶血的可能性较大，但并不是其他的血型没有导致溶血的可能。
甲状腺功能异常可能引起胎儿生长发育的异常或停滞。生殖激素异常，如促卵泡激素（FSH)过高提示卵巢功能下降，卵子质量降低，染色体异常的发生率增加；高泌乳素血症和高雄激素血症会抑制卵泡的生长发育或影响卵子的质量。凝血功能如凝血四项或D-二聚体水平异常，可能会影响胚胎在子宫内膜的种植及绒毛的生长。
自身免疫抗体阳性，可能会导致妈妈的高凝状态，即“易栓症”，进而影响胚胎的发育。五种产前病毒，检查的抗体分两种，IgG和IgM。前者提示既往感染，是一种保护性抗体，后者提示近期感染，需治疗后再妊娠，否则可能引起胎儿畸形等。男方精子的畸形率过高，可能存在Y染色体的异常，此时也建议查一查AZF，即Y染色体的微缺失。
找出原因后，纠正异常的体内环境，哪里异常就治哪里。但是染色体的问题没法纠正，只能减少或避免染色体异常的胚胎种植。此时可以借助胚胎植人前遗传学筛查（PGS)或胚胎植人前遗传学诊断（PGD)这个技术的帮助。
孕周稍大的时候发生流产，则需要考虑宫颈松弛、胎儿畸形或某些原因引起的胎膜早破。宫颈松弛或宫颈机能不全的患者在诊断明确后，需就诊于产科，在孕前或孕期第13〜18周做宫颈环扎术，防止再次出现流产。重大的胎儿畸形也会导致胎儿死亡，排畸超声和唐氏筛查能帮助鉴别。阴道炎或宫内感染、长时间站立或过于劳累可能导致胎膜早破，进而发展为流产。
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